1.事业单位现行会计制度存在的问题
1.1会计目标定位不明确：会计目标是会计理论基本结构的最高层次，是为了满足使用者的需求，提供其相关的财务信息而设定的。但是，目前我国事业单位正使用的会计目标，在财务信息处理和定位上不够全面，达不到应有的需求，尤其是信息的提供量相对比较狭窄，这样阻碍了信息使用者对事业单位运营现状及服务水准的把握和确定，不能全面的反应社会公众所委托责任的履行情况。使事业单位会计制度在管理应用中起不到应有的作用。
1.2核算的基础和方法不合理：现如今事业单位使用的现行会计核算基础是收付实现制。所谓的收付实现制就是按照收付日期确定本期收费。理论上说，就是无论是否是本期的收入和费用，只要在本期收到都归属于本期的费用和收入，如果，原本应属本期的收入，在本期没有费用，也不能算人本期的收入和费用。这样，使得不能客观的反应当期的成本费用，不能有效的遵循配比原则，不能真实的反应资产负债状况，导致信息失真，监督和管理失去成效。同时核算的方法还不够完善，存在诸多漏洞，例如：同定资产的处理方式上，把一些已经失去价值的资产，不能带给单位任何利益的资产仍保持价值不变。这样就严重的造成资产的反应不实，影响了会计信息的真实性。从而造成决策的失误，造成经济损失。
1.3会计报告体系存在一定的问题：事业单位的会计报表是衡量及正确反映单位在一个阶段的财务收支状况，是单位及投资者等信息需求者把握事业单位现状的根本途径。现如今，事业单位的会计报告存在普遍的现象，就是在事业单位的会计报告体系中，资产负债表过于杂乱，既包含收支项目，又包含资产项目，而收支项目在收支表中也有罗列，这样的做法虚增了资产的总额，而且难以真实的反应负债情况，失去了核算的真实性。而且在事业单位会计报表中，没有现金流量表，没有反应实际与预算之间的差异，造成了事业单位的收支增减变动情况得不到真实的披露。对这对信息需求使用者了解预算执行情况造成很大程度上的影响，使信息使用者做出错误的决策，造成经济上的严重损失。
2.事业单位会计制度改革措施
2.1设定能正确反应事业单位经济实质的会计目标：由于世界一体化趋势的加强，国与国之间交流日渐加深，这样对于会计目标也带来了一定的影响，由于西方一些市场经济发达的国家实行”决策有用观”。所以，中国也加以借用直至现行接受。致使事业单位偏重于决策功能，从而忽略了 会计的监督功能，监督是为了强化事业单位内部的管理，实现经济管理，防范及制止因为行为的过失所造成的经济损失。然而，”决策有用观”却忽略了监督的功能，这样就严重的造成管理混乱，致使存在经济的隐患。所以，事业单位要想取得更好的发展，在社会上确立可靠的信誉度。在会计目标的选择上，要设定一个能真实客观的反应事业单位经济实质的会计目标。这样，才能提高会计监督职能的发挥，进而做好事业单位的管理，才能真实有效的披露事业单位的信息情况，使信息使用者做出正确的决策，从而提高事业单位的经济发展。
2.2建立健全会计的控制制度，制定有效的核算方法：我国虽然有统一的会计管理制度，但是对于事业单位来说过于宽泛。对于一个单位的会计制度来说，它关系着一个事业单位的内部管理，而内部管理是加强会计核算和信息质量的必然要求。信息质量的正确披露是使用者做好正确决策的必然途径。然而一些事业单位，没有根据本单位的情况，做到一切从实际出发，套用国家事业单位的会计制度，致使出现管理上的桎梏，从而影响现代财务体制的改革。所以，加强事业单位的会计控制制度，结合自身的情况，借鉴以往改革中的精华，制定合理科学统一的事业单位会计制度，可以有效的从思想上确立对会计制度的重视程度，加大内部审计队伍的建设，从而提高会计人员的职业道德水平和审计业务素质。这样，还有效的规范了职责的分配，减轻会计人员的日常处理工作量，使其有更多的精力投身于企业的制度管理中去，这样达到内部管理的完善，进而使会计制度有效发挥作用，这样，才能及时的反馈事业单位所存在的问题，很大程度上改善了我国事业单位的会计信息质量，从而制定出相应的会计核算办法。
2.3财务报告体系的完善：要想使事业单位顺应社会发展，适应事业单位改革的要求，满足各个层次不同信息需求的目标。现如今，必须构建合理的全新的财务报告体系。现行的事业单位资产负债表，既包括收支项目也包括资产、负债等项目，收支报表中也反映收支项目。所以出现一定的重复现象，使信息达不到如实的反映，导致决策失误。针对这一现象，作为会计报表，要做好各项目的均衡分配，具有一定的侧重点。所以，对于资产负债表的编制，要尽可能的将收支项目剔除。凭借负债与净资产的综合作为资产为依据，这样，便能体现事业单位的会计主体地位，使事业单位资产流失情况的发生防患于未然。为决策提供强有力的信息保障。然后要加入现金流量表。现金流量表的缺失，影响了正确信息的披露，没有反应实际与预算之间的差异，影响决策。所以，增加现金流量表，这样可以将收支项目放在专项的收支附表中。不但如此，还可以充分反映事业单位在一定期间的现金流入和流出的整体情况，帮助信息使用者了解事业单位的资金状况，从而更好地进行决策。同时也有利于对事业单位整个现金流量、资产量进行全面的分析，从而更好的反映在运作实施过程中各个环节虽出现的问题，进而做到有效的矫正、分析。这样才能真实有效的反应事业单位的信息情况，以便做出科学的决策。
结束语：随着社会经济的高速发展，我国事业单位会计制度面临着新一轮的改革。针对现如今，事业单位会计制度中现存的问题，足以表明，新一轮的会计制度改革是一把双刃剑，它既是一个新机遇，又是一个严峻的挑战。所以，事业单位在改革中，要全力配合国家的相关政策，借鉴以往的改革成功经验。这样才能确立一个更加符合社会发展，更加科学的会计制度。
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