企业内部控制系统的主要目标是企业资产的安全完整、提高企业经营管理的效率效果，提高经济效益。为了实现这一目标，内部控制系统必须解决企业组织面临的两个方面的问题：一是业绩衡量的模糊性程度；二是员工个人目标与企业目标的不一致程度。由于现代企业规模庞大，组织结构复杂，很难判断单个部门和个人对组织或部门经营业绩的边际贡献，这就产生了业绩衡量的模糊性问题；另外，企业作为一个整体，其目标是企业经营利润的最大化，而对于企业组织员工个人而言，其目标是自身个人利益的最大化，员工个人目标与企业目标的矛盾将直接影响企业的经营成果。企业组织内部的模糊性程度和不一致程度不同，内部控制系统三个维度的作用程度就不同：一般来讲，在业绩性低、目标不一致性高的条件下，市场控制维度较为有效；在业绩模糊性和目标不一致性均相当高的条件下，制度控制维度较为有效；而在目标不一致性低、业绩模糊性高的条件下，则文化控制维度最为有效。
1制度控制
制度有广义、狭义之分。广义上的制度指的是一种行为规则，这些规则涉及社会、政治及行为。从最一般的意义上讲，制度可以理解为社会中个人遵循的一套行为规则。狭义上的制度仅指企业组织的官僚制，它是与市场机制相互替代的交易治理机制。我们所指的制度是狭义上的制度观念，即企业组织的官僚制结构。
以制度规范为基本手段协调企业组织集体协作行为的内部控制机制就是制度控制。制度的规范没有严格的界限，可以用多种标准进行分类，按照制度规范涉及到的层次和约束的不同内容，可以分为企业基本制度、管理制度、技术规范、业务规范四种类型。①企业基本制度。企业基本制度主要包括企业的法律和财产所有形式、企业章程、股东大会、董事会、监事会组织、高层管理等方面的制度和规范。它确定了企业所有、经营管理人员、企业组织成员各自的权利、义务和相互关系，确定了财产的所有关系和分配方式，制约着企业活动的范围和性质，是涉及企业所有层次、决定企业组织的根本方式。②管理制度。管理制度是对企业管理各基本方面活动框架，调节集体协作行为的制度。管理制度比企业基本制度层次略低的制度规范。它是用来约束集体行为的成体系的活动和行为规范，主要针对集体而非个人。③技术规范。技术规范是涉及某些技术标准、技术规程的规定，它反映生产和流通环节中客观事物的内在技术要求、科学性和规律性，是经济活动中予以尊重的。④业务规范。业务规范是针对业务活动过程中那些大量存在、反复出现，又能摸索出科学处理方法的事物所制定的作业处理规定。业务规范所规定的对象具有可重复性特点。
制度控制机制主要适用于资产专用性程度比较高、内部交易对象缺乏市场参照价格的发型。制度控制的不足主要体现在对外部市场环境变化反应的滞后性上。
2 市场控制
在市场控制下，外部市场力量用来控制管理行为。竞争规则、供求关系调节组织内的行为活动。分权组织中典型的市场控制方式是运用转移价格机制决定组织单位间的关系。组织单位拥有自治权，自主决定是否在组织内部或外部购买或销售产品。
市场控制机制的优点是能够提供高能激励。体现在三个方面：
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第一反映周期短。一是在组织内部不同部门单位的相互协调关系方面，组织内部的资源转移和报酬确定完全依赖于各方的协商和讨价还价结果，竞争压力、供求关系最终判断组织单位决策的正确性，并为管理者保持或调整其管理行为提供信号；二是在整体的战略导向方面，以外部市场信号为导向，及时调整组织内部的资源分配关系，以对市场供求变化作出迅速反应。第二，竞争的激励。市场模式能够促进竞争，而竞争提供一种隐含的、非合同式的激励功能。第三，工作满足感。在市场控制模式下，内部转移价格的确定并非是外部强加的，管理者可以自行决定产品、服务的生产方式、生产成本、输出价格等方面，完善的激励补偿系统又使得管理者取得的报酬与实现的业绩相一致，因此，管理者可以充分施展自己的经营管理才能。
市场控制机制的不足主要体现在有时无法实现企业的整体目标。在市场控制模式下，各个经营单位或部门各自为政，按照自身单位利润最大化的原则进行经营管理，各个部门或单位都是企业组织整体系统的子系统，每个子系统追求最优的行为不可能导致企业组织整体绩效的最优化。
3 文化控制
所谓企业文化，就是一个企业在长期的经营过程中，由企业经营者提炼和培养出来的一种适合本企业特点的经营管理的方式，是企业群体所共同认可的特有的价值观念、行为规范及奖惩规则等的总和。
企业文化是需为监督付出高昂的价格性激励系统的替代物。本来企业为了实现战略经营目标需要以管理补偿的方式促使管理者努力工作，而企业文化则尝试以改变管理者的偏好来达到同样的目的。也就是说，企业文化可以使管理者激励内部化，使企业目标成为管理者个人的目标。企业文化的构成要素包括企业价值观、企业形象、企业道德、企业学者等。企业文化的控制功能体现在以下方面：
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第一，激励内部化。制度控制和市场控制下的激励因素来自于外部，企业为了实现战略经营目标需要以管理补偿方式促使管理者努力工作，而企业文化则尝试以改变管理偏好来达到同样的目的。第二，目标一致性。在市场控制下，组织控制完全依存于经济利益上的联系。但是这种联系势必伴随着大量的利益冲突，从而存在的导致无序的可能性。而通过一套规范来控制大众的行为；通过一套信念和价值观增加人们对组织的认同，增强组织的凝聚力，于是导致无序的严重利益冲突受到有效抑制，提高组织目标与个人目标的一致性程度。第三，减低不确定性。企业组织是在不断变化的环境中生存发展的，但是企业并不希望周围环境同时改变，它们需要一些因素是稳定的。企业文化使群体成员形成共识，促使大家一致朝共同方向努力，从而增加了防御风险的能力。人们普遍认为在竞争性的经济中，强有力的文化对于创造一个成功的企业是十分重要的。
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