企业对财务风险的应对措施主要有接受风险、规避风险、降低风险和转移风险四种。专业合作社控制风险的总原则是：结合自身的特点，认真分析风险产生的原因，充分考虑风险应对的成本和收益，权衡利弊，采取合适有效的风险应对措施。
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第一，委托专业人士进行财务管理和相关专业管理。委托专业人士进行财务管理和专业管理实质是一种业务外包。专业合作社业务外包可以发挥社员的农业技术优势，避免财务管理和相关专业管理上的劣势。委托外包可以有效规避税收风险和财政补助风险，降低生物资产在筹资出资、生产运营的部分风险，控制各个过程的舞弊风险。
第二，建立严格的舞弊赔偿处罚制度。在专业合作社设立章程中，设立较为严格和具有较强操作性的舞弊赔偿制度。例如，建立举报有奖制度，提高舞弊风险的（及时）发现概率，同时，对舞弊者处以较高的赔偿处罚制度，除了全部承担损失或收益归专业合作社所有外，还可以设立处以若干倍的处罚，处罚收入归专业合作社其他成员所有。舞弊的高发现概率和高额赔偿处罚，可以有效控制舞弊风险。
第三，购买农业保险和补充商业保险。自然灾害和病虫害对生物资产造成的减产等损失，可以通过购买农业保险来控制，还可以购买部分商业保险弥补农业保险保额的不足。这样，对于专业合作社来说，可以有效降低生物资产的不可控风险。这实质是风险转嫁策略，把部分生物资产风险转移给政府和商业保险机构。
第四，积极稳妥参与农产品期货交易。对于未来产量预期确定的农产品，其农产品价格变动风险，专业合作社可以采取积极的态度，稳健地参与农产品期货交易，以锁定收益，降低农产品价格波动带来的风险。在参与过程中，专业合作社要结合自身风险承受能力，确定合适的期货交易策略。特别需要指出的是，由于资产规模和管理水平限制，合作社参与期货交易的目的仅是锁定自产产品的价格，保障合作社稳定的收益，因此不能参与农产品期货的套利行为，尤其不能采取“做空”方式套利，即先行卖出超过本社产量的农产品。
第五，积极稳妥参与农产品期货交易。对于农资价格变动风险，合作社可以根据未来生产经营情况预测农资需求量，结合市场农资价格走向，建立农资合理储备量。这实质是通过建立农资实物期货来控制价格变动风险。
第六，盈余提取风险准备金。专业合作社从盈余中提出一定比例的金额，建立风险准备金，从而提高专业合作社综合应对的抗风险能力。这实质是通过建立自身储备来“以丰补歉”，用“时间交错配合”来抵抗风险，防止专业合作社面临破产清算风险。从总体上说，这属于风险接受的控制策略。
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