为了与新的税收征管法相配套，２００２年９月国务院公布了新的《中华人民共和国税收征收管理法实施细则》（以下简称“新《实施细则》”）。新《实施细则》已从２００２年１０月１５日起实行。与原《实施细则》相比，新《实施细则》的规定更详细更全面。尤其在加强税收征管、税源监控、税务登记制度、关联企业交易界定和税收系统信息化建设等方面，新《实施细则》增加了一些条款，具体概括如下：
１、为适应信息时代的需要，要求加强税务系统的信息化建设。新《实施细则》中规定：国家税务总局负责制定全国税务系统信息化建设的总体规划、技术标准、技术方案与实施办法；各级税务机关应当按照国家税务总局的总体规划、技术标准、技术方案与实施办法，做好本地区税务系统信息化建设的具体工作。地方各级人民政府应当积极支持税务系统信息化建设，并组织有关部门实现相关信息共享。同时规定国家税务局、地方税务局对同一纳税人的税务登记应当采用同一代码，实现信息共享。在纳税申报中，新《实施细则》规定纳税人、扣缴义务人可以采取税务机关确定的电话语音、电子数据交换和网络传输等电子方式办理纳税申报。
２、为加强税源监控，强化了与工商管理机关、财政机关和审计机关等部门的联系；强化了银行等金融机构的监督职责；积极鼓励群众依法监督税收征管工作。新《实施细则》规定各级工商行政管理机关应当向同级国家税务局和地方税务局定期通报办理开业、变更、注销登记以及吊销营业执照的情况。同时规定审计机关、财政机关依法进行审计、检查时，对税务机关的税收违法行为作出的决定，税务机关应当执行；发现被审计、检查单位有税收违法行为的，向被审计、检查单位下达决定、意见书，责成被审计、检查单位向税务机关缴纳应当缴纳的税款、滞纳金。
税务机关应当根据有关机关的决定、意见书，依照税收法律、行政法规的规定，将应收的税款、滞纳金按照国家规定的税收征收管理范围和税款入库预算级次缴入国库。
有关银行等金融机构的监督职责规定：银行和其他金融机构未依照税收征管法的规定在从事生产、经营的纳税人的账户中登录税务登记证件号码，或者未按规定在税务登记证件中登录从事生产、经营的纳税人的账户账号的，由税务机关责令其限期改正，并处２千元以上２万元以下的罚款；情节严重的，处２万元以上５万元以下的罚款。为鼓励群众对税收征管工作的监督，规定税务机关根据检举人的贡献大小给予相应的奖励，奖励所需资金列入税务部门年度预算，单项核定。
３、为严格税务登记制度，新《实施细则》不仅规定“从事生产、经营的纳税人应当自领取营业执照之日起３０日内，向生产、经营地或者纳税义务发生地的主管税务机关申报办理税务登记，如实填写税务登记表，并按照税务机关的要求提供有关证件、资料”，还规定了纳税人在办理“开立银行账户；申请减税、免税、退税；申请办理延期申报、延期缴纳税款；领购发票；申请开具外出经营活动税收管理证明；办理停业、歇业以及其他有关税务事项”时，必须持税务登记证件办理。税务机关对税务登记证件实行定期验证和换证制度。纳税人应当在规定的期限内持有关证件到主管税务机关办理验证或者换证手续。纳税人未按照规定办理税务登记证件验证或者换证手续的，由税务机关责令限期改正，处２千元以下的罚款；情节严重的，处２千元以上１万元以下的罚款。
４、为防止关联企业发生非法避税行为，新《实施细则》不仅详细阐明了关联企业的定义为“有下列关系之一的公司、企业和其他经济组织，即《税收征管法》所称的关联企业：一是在资金、经营、购销等方面，存在直接或者间接的拥有或者控制关系；二是直接或者间接地同为第三者所拥有或者控制；三是在利益上具有相关联的其他关系”，还规定“纳税人有义务就其与关联企业之间的业务往来，向当地税务机关提供有关的价格、费用标准等资料”。对关联企业之间发生的以非法避税为目的的非正常的业务往来和资金往来，税务机关可以按照有关规定调整其计税收入额或者所得额。
新《实施细则》还规定，纳税人与其关联企业之间的业务往来有下列情形之一的，税务机关可以调整其应纳税额：一是购销业务未按照独立企业之间的业务往来作价；二是融通资金所支付或者收取的利息超过或者低于没有关联关系的企业之间所能同意的数额，或者利率超过或者低于同类业务的正常利率；三是提供劳务未按照独立企业之间业务往来收取或者支付劳务费用；四是转让财产、提供财产使用权等业务往来未按照独立企业之间业务往来作价或者收取、支付费用；五是未按照独立企业之间业务往来作价的其他情形。对于调整关联企业应纳税额的具体措施，新《实施细则》提供了四种计算方法：即按照独立企业之间进行的相同或者类似业务活动的价格计算；按照再销售给无关联关系的第三者的价格所应取得的收入和利润水平计算；按照成本加合理的费用和利润计算；按照其他合理的方法计算。对纳税人与其关联企业未按照独立企业之间的业务往来支付价款、费用的，税务机关自该业务往来发生的纳税年度起３年内进行调整；有特殊情况的，可以自该业务往来发生的纳税年度起１０年内进行调整。
５、为保护纳税人权益，改变过去单纯强调纳税人义务，强调为纳税人服务，强调诚信原则，大力提倡诚信纳税。新《实施细则》规定税务机关要为纳税人、扣缴义务人的商业秘密及个人隐私保密。税务机关对单价５千元以下的其他生活用品，不采取税收保全措施和强制执行措施。
纳税人有下列情形之一的：因不可抗力导致纳税人发生较大损失，正常生产经营活动受到较大影响的；当期货币资金在扣除应付职工工资、社会保险费后，不足以缴纳税款的，经省、自治区、直辖市国家税务局、地方税务局批准，可以延期缴纳税款。在税务检查中，税务机关应当建立科学的检查制度，统筹安排检查工作，严格控制对纳税人、扣缴义务人的检查次数。在诚信纳税方面，新《实施细则》规定县级以上各级税务机关应当将纳税人的欠税情况，在办税场所或者广播、电视、报纸、期刊、网络等媒体上定期公告。同时规定税务机关负责纳税人纳税信誉等级评定工作。
６。为使税务机关能够自我约束和受到广泛的社会监督，将公平、公开、公正的理念贯彻到具体税收执法行为中，新《实施细则》规定上级税务机关发现下级税务机关的税收违法行为，应当及时予以纠正，下级税务机关应当按照上级税务机关的决定及时加以改正；下级税务机关发现上级税务机关的税收违法行为，应当向上级税务机关或者有关部门报告。同时规定税务人员在核定应纳税额、调整税收定额、进行税务检查、实施税务行政处罚、办理税务行政复议时，与纳税人、扣缴义务人或者其法定代表人、直接责任人，有夫妻关系、直系血亲关系、三代以内旁系血亲关系、近姻亲关系，可能影响公正执法的其他利害关系时应当回避。在税款征收中，规定税务机关不得占压、挪用、截留，不得缴入国库以外或者国家规定的税款账户以外的任何账户。在税务检查中，规定税务机关应当制定合理的税务稽查工作规程，负责选案、检查、审理，执行人员的职责应当明确，并要相互分离、相互制约，规范选案程序和检查行为。
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