含有叶绿素和藻蓝素。蓝细菌与其它光合细菌最大的区别是，其它光合细菌在光合过程中不会放出氧气，而蓝细菌却能源源不断地往空中输送氧气。经过长期不断地释放氧气，终于改变了大气的组成，进而在高空形成臭氧层，挡住了紫外线，为以后的需氧生物提供了有利的生存环境，并为海洋生物登陆提供了条件。
1蓝细菌
蓝细菌的细胞一般比细菌大，通常直径为3～10μm，最大的可达60μm，如巨颤蓝细菌。根据细胞形态差异，蓝细菌可分为单细胞和丝状体两大类。单细胞类群多呈球状、椭圆状和杆状，单生或团聚体，如粘杆蓝细菌和皮果蓝细菌等属;丝状体蓝细菌是有许多细胞排列而成的群体，包括：有异形胞的(如鱼腥蓝细菌属)，无异形胞的(如颤蓝细菌属)，有分支的(如费氏蓝细菌属)。
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