清雍正四年（1726年），奉贤建县后，庄行地属奉贤县白沙乡十三保，云间乡十二保。
清宣统三年（1911年），庄行属江苏省苏州布政司松江府奉贤县西三乡。
民国18年（1929年），庄行为江苏省松江地区奉贤县第八区。
民国22年（1933年），改为第二区。
民国26年（1937年），日伪在上海浦东成立上海大道市政府后，改上海市政督办，庄行为奉贤县之一镇。
民国31年（1942年），系伪上海特别区奉贤特别区第二分区。
民国35年（1946年），改属江苏省第三行政督察专员公署奉贤县庄行区。
民国36年（1947年）改为庄行镇。
1949年5月14日，奉贤全境解放。全县分为六区一镇，隶属苏南行政公署松江专区，庄行区为奉贤县第二区。
1957年7月，撤区并乡，高级社代替基层行政村。原庄行镇、芦泾乡、烟墩乡、华严乡、潘垫乡合并建立庄行乡，下辖19个农业生产高级合作社，实行乡治制。
1958年10月，成立东风人民公社。
1959年春，改名庄行人民公社，此后，实行“政社合一”的人民公社建置25年不变。
1984年3月，政社分设，建立庄行乡人民政府，恢复乡治制，实行乡管村体制。庄行人民公社作为经济组织继续保留，
1987年8月，成立庄行乡农工商联合社，取代人民公社职能。
1994年2月9日，撤乡建镇，经上海市人民政府批准撤销庄行乡建制，建立庄行镇，实行镇管村体制。
2003年12月1日，奉贤区镇级行政区划调整，撤销原庄行镇、邬桥镇，两镇合并建立新的庄行镇，继续实行镇管村体制。
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