问题：
[多选] 根据《公路工程基本建设项目概算预算编制办法》，以各类工程的直接工程费之和作为基数计算费用的有（ ）。A . 雨期施工增加费
B . 夜间施工增加费
C . 高原地区施工增加费
D . 施工辅助费
E . 企业管理费
参考解析：
根据《公路工程基本建设项目概算预算编制办法》，以各类工程的直接工程费之和作为基数计算的费用包括：冬期施工增加费、雨期施工增加费、沿海地区工程施工费、安全及文明施工措施费、临时设施费、施工辅助费、工地转移费等。
B、C、E三项均不是以各类工程的直接工程费之和作为基数计算的费用。夜间施工
增加费=∑夜间施工工程项目的直接工程费×夜间施工增加费费率(％)；高原地区施工
增加费=∑(各类工程人工费+施工机械使用费)×高原地区施工增加费费率(％)；企业管理费由基本费用、主副食运输补贴、职工探亲路费、职工取暖补贴和财务费用五项组成。选项“B、C、E”错误。
按照编制办法的要求规定，故本题正确选项应为“A、D”。
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